La AEC es de ámbito nacional y agrupa a un gran número de investigadores y profesionales de distintas ciencias (geógrafos, físicos, meteorólogos, geólogos, etc.).
Sus órganos de Gobierno son dos:
Asamblea General. Es el órgano supremo de la Asociación, constituida por todos los miembros de honor, numerarios y representantes de los miembros corporativos. Se convoca al menos una vez al año.
Junta Directiva. Es el órgano ejecutivo y de representación permanente de la Asociación. Formada por un Presidente, un Secretario, un Tesorero y cuatro Vocales. Se reúne al menos una vez al año.
Domingo F. Rasilla, Presidente de la AEC
En la Asamblea Extraordinaria celebrada del 21 de diciembre de 2020, se procedió a la renovación de cargos de la Junta Directiva, que quedó constituida de la siguiente manera:
Presidente: Domingo Fernando Rasilla Álvarez. Dpto. de Geografía, Urbanismo y Ordenación del Territorio. Universidad de Cantabria. Correo electrónico: domingo.rasilla@unican.es
Secretario: Pablo Lucas Mayer Suárez. Dpto. de Geografía. Universidad de Las Palmas de Gran Canaria. (Gran Canaria). Correo electrónico: pablo.mayer@ulpgc.es
Tesorero: Roberto Serrano Notivoli. Dpto. de Geografía. Universidad Autónoma de Madrid. Correo electrónico: roberto.serrano@uam.es
Vocales: Yolanda Luna Rico, Jefa del Departamento de Desarrollo y Aplicaciones de la Agencia Estatal de Meteorología (AEMET), Madrid; Jordi Salat, Instituto de Ciencias del Mar de Barcelona (SIC); Mónica Aguilar Alba, Dpto. Geografía Física.y Análisis Geográfico Regional, Universidad de Sevilla; Miguel Ángel Saz. Dpto. de Geografía y Ordenación del Territorio. Universidad de Zaragoza.